美國出現“德爾塔+奧密克戎”超級變種病毒
Erin Prater
2022-03-15
2020年5月20日，在巴西圣保羅一家前男子醫院的重癥監護室（ICU）里，醫生檢查一名新冠肺炎患者后開始救治，該醫院已經被改造成收治新冠肺炎患者的戰地醫院。圖片來源：MARIO TAMA—GETTY IMAGES
據研究網站medRxiv在3月12日發表的一項新研究顯示，自今年1月以來，美國加州的一家實驗室發現了兩例新冠病毒變體“德爾塔克戎”（Deltacron），這意味著美國可能已經出現了新變體。
美國疾控中心（U.S. Centers for Disease Control）下屬 Helix 實驗室位于加州圣馬特奧，在對2021年11月到今年2月期間的近3萬份美國人新冠陽性樣本進行測序時，發現了兩例獨特的德爾塔和奧密克戎重組體。該研究發表在由耶魯大學（Yale University）和《英國醫學雜志》（The British Medical Journal）聯合創立的預印本服務器上，該論文尚未經同行評審。
研究稱，德爾塔和奧密克戎重組體（具有德爾塔和奧密克戎變體特征的新型冠狀病毒基因組，被稱為重組體）非常罕見。該研究補充稱，還沒有發現該突變比高傳染性的奧密克戎更容易傳播的證據。
此外，該研究發現了20例同時感染德爾塔和奧密克戎的病例，其中包括一例少量重組病毒感染病例。研究作者稱，目前正在審查的另一項研究中已經報告了兩例混合感染病例。
塞浦路斯大學（University of Cyprus）的病毒學家萊昂迪奧斯·科斯特里基斯博士于1月7日宣布，已經鑒定出幾種所謂的德爾塔克戎重組體。《自然》雜志（Nature）在1月21日刊登的《德爾塔克戎：并不是變體》（Deltacron: the story of the variant that wasn't）的文章宣稱，他的團隊當天將25個序列上傳至全球共享流感數據倡議組織（GISAID）數據庫，幾天后又上傳了27個序列，GISAID是一家追蹤新冠病毒和流感病毒變化的國際研究機構。
次日，彭博社（Bloomberg）報道了這個消息。一夜之間，德爾塔克戎成了國際新聞。
然而，一些專家提醒道，德爾塔和奧密克戎重組病毒不可能這么快出現。多位專家堅持認為，發現的序列并不是重組體，序列很可能是實驗室污染導致。
但是質疑者錯了。世界衛生組織（World Health Organization）的新冠病毒技術負責人、傳染病流行病學家瑪麗亞·范·科爾霍夫博士在3月9日的媒體吹風會上承認，確實存在德爾塔（也稱AY.4）和奧密克戎（也稱BA.1）的混合體。
她說，在法國、荷蘭和丹麥已經發現了突變，并補充稱發現的病毒量“非常少”，同時表示該突變并不令人意外。
“由于感染規模龐大，奧密克戎和德爾塔都導致了大量感染，新變體出現在意料之中。”她說。
“病毒就是這樣，過一段時間就會變異。”
此外，新冠病毒正在逐漸感染動物，有可能傳回人類，造成更多的突變。
“所以，再強調一次，新冠疫情還遠沒有結束。”她說。“不能讓病毒猛烈傳播。”
曾經在哈佛大學（Harvard University）學習的科羅拉多學院（Colorado College）的微生物學教授菲比·洛斯特羅博士表示，病毒重組很常見。科羅拉多學院是位于科羅拉多斯普林斯的私立文理學院。
包括細菌、病毒、真菌和原生動物在內的微生物“進化得比人類快，因為能夠在非常短的時間內繁殖。”她說。
流感就是典型的例子。
“有趣的是，1918-1919年大流感已經過去這么多年，之后每一次全球性（流感）疫情中，病毒都至少帶一些當年的基因。”她說。
作者聲稱，Helix研究的發現基本不可能因為污染或技術人為因素，他們引用了不同日期對混合染樣本的重新測序和處理流程，還有其他證據。
3月8日發表在《臨床調查雜志》（The Journal of Clinical Investigation）的一項研究發現，有證據表明，西班牙五名完全接種疫苗的新冠肺炎患者感染了2020年年底席卷英國的阿爾法變體毒株，該變體具有德爾塔+（Delta Plus）、約塔 （Iota）和奧密克戎的特征。
目前，“德爾塔克戎”只是媒體用詞。科學家們還沒有正式命名。世界衛生組織和美國疾控中心均未將其列為受關注的變體。（財富中文網）
譯者：梁宇
審校：夏林
據研究網站medRxiv在3月12日發表的一項新研究顯示，自今年1月以來，美國加州的一家實驗室發現了兩例新冠病毒變體“德爾塔克戎”（Deltacron），這意味著美國可能已經出現了新變體。
美國疾控中心（U.S. Centers for Disease Control）下屬 Helix 實驗室位于加州圣馬特奧，在對2021年11月到今年2月期間的近3萬份美國人新冠陽性樣本進行測序時，發現了兩例獨特的德爾塔和奧密克戎重組體。該研究發表在由耶魯大學（Yale University）和《英國醫學雜志》（The British Medical Journal）聯合創立的預印本服務器上，該論文尚未經同行評審。
研究稱，德爾塔和奧密克戎重組體（具有德爾塔和奧密克戎變體特征的新型冠狀病毒基因組，被稱為重組體）非常罕見。該研究補充稱，還沒有發現該突變比高傳染性的奧密克戎更容易傳播的證據。
此外，該研究發現了20例同時感染德爾塔和奧密克戎的病例，其中包括一例少量重組病毒感染病例。研究作者稱，目前正在審查的另一項研究中已經報告了兩例混合感染病例。
塞浦路斯大學（University of Cyprus）的病毒學家萊昂迪奧斯·科斯特里基斯博士于1月7日宣布，已經鑒定出幾種所謂的德爾塔克戎重組體。《自然》雜志（Nature）在1月21日刊登的《德爾塔克戎：并不是變體》（Deltacron: the story of the variant that wasn't）的文章宣稱，他的團隊當天將25個序列上傳至全球共享流感數據倡議組織（GISAID）數據庫，幾天后又上傳了27個序列，GISAID是一家追蹤新冠病毒和流感病毒變化的國際研究機構。
次日，彭博社（Bloomberg）報道了這個消息。一夜之間，德爾塔克戎成了國際新聞。
然而，一些專家提醒道，德爾塔和奧密克戎重組病毒不可能這么快出現。多位專家堅持認為，發現的序列并不是重組體，序列很可能是實驗室污染導致。
但是質疑者錯了。世界衛生組織（World Health Organization）的新冠病毒技術負責人、傳染病流行病學家瑪麗亞·范·科爾霍夫博士在3月9日的媒體吹風會上承認，確實存在德爾塔（也稱AY.4）和奧密克戎（也稱BA.1）的混合體。
她說，在法國、荷蘭和丹麥已經發現了突變，并補充稱發現的病毒量“非常少”，同時表示該突變并不令人意外。
“由于感染規模龐大，奧密克戎和德爾塔都導致了大量感染，新變體出現在意料之中。”她說。
“病毒就是這樣，過一段時間就會變異。”
此外，新冠病毒正在逐漸感染動物，有可能傳回人類，造成更多的突變。
“所以，再強調一次，新冠疫情還遠沒有結束。”她說。“不能讓病毒猛烈傳播。”
曾經在哈佛大學（Harvard University）學習的科羅拉多學院（Colorado College）的微生物學教授菲比·洛斯特羅博士表示，病毒重組很常見。科羅拉多學院是位于科羅拉多斯普林斯的私立文理學院。
包括細菌、病毒、真菌和原生動物在內的微生物“進化得比人類快，因為能夠在非常短的時間內繁殖。”她說。
流感就是典型的例子。
“有趣的是，1918-1919年大流感已經過去這么多年，之后每一次全球性（流感）疫情中，病毒都至少帶一些當年的基因。”她說。
作者聲稱，Helix研究的發現基本不可能因為污染或技術人為因素，他們引用了不同日期對混合染樣本的重新測序和處理流程，還有其他證據。
3月8日發表在《臨床調查雜志》（The Journal of Clinical Investigation）的一項研究發現，有證據表明，西班牙五名完全接種疫苗的新冠肺炎患者感染了2020年年底席卷英國的阿爾法變體毒株，該變體具有德爾塔+（Delta Plus）、約塔 （Iota）和奧密克戎的特征。
目前，“德爾塔克戎”只是媒體用詞。科學家們還沒有正式命名。世界衛生組織和美國疾控中心均未將其列為受關注的變體。（財富中文網）
譯者：梁宇
審校：夏林
The so-called "Deltacron" COVID variant appears to be present in the U.S., with two cases identified by a California-based lab since January, according to a new study published on March 12 to research site medRxiv.
The U.S. Centers for Disease Control-affiliated lab Helix, based in San Mateo, Calif., found two unique cases of Delta-Omicron hybrids when sequencing nearly 30,000 positive COVID samples obtained from U.S. individuals between November and February, according to the study, published to a preprint server for health sciences papers that haven't yet been peer reviewed, cofounded by Yale University and The British Medical Journal.
The Delta-Omicron hybrids—SARS-CoV-2 genomes with features of both Delta and Omicron variants of COVID, known as recombinants—are rare, according to the study, which added that there is no evidence such mutations spread more easily than the highly transmissible Omicron.
Additionally, the study identified 20 cases in which individuals were infected with both Delta and Omicron at the same time, including one such case that included a low level of recombinant virus. Two cases of coinfection have already been reported in another study currently under review, the study's authors stated.
Dr. Leondios Kostrikis, a virologist at the University of Cyprus, announced Jan. 7 that he had identified several so-called Deltacron recombinants. His team uploaded 25 of the sequences to GISAID, an international research organization that tracks changes in COVID and the flu virus, that day, and 27 more a few days later, according to a Jan. 21 Nature piece titled "Deltacron: the story of the variant that wasn't."
The next day, Bloomberg picked up the news. Overnight, the so-called Deltacron became an international story.
Not so fast, some experts cautioned, with many insisting that a recombinant hadn't been born, but that the sequences discovered were the likely product of laboratory contamination.
But the naysayers were wrong. World Health Organization COVID-19 technical lead Dr. Maria Van Kerkhove, an infectious disease epidemiologist, addressed the variant at a March 9 media briefing, acknowledging the existence of the blend of Delta, also known as AY.4, and Omicron, also known as BA.1.
It had been identified in France, the Netherlands, and Denmark, she said, adding that levels of detection were "very low" and that such mutations come as no surprise.
"This is something that is to be expected, given the large amount of circulation, the intense amount of circulation we saw with both Omicron and Delta," she said.
"This is what viruses do. They change over time."
Additionally, COVID is infecting animals, with possibility of infecting humans again, creating additional chances for mutations.
"So, again, this pandemic is far from over," she said. "We cannot allow this virus to spread at such an intense level."
The development of recombinants is common among viruses, said Dr. Phoebe Lostroh, a Harvard-trained microbiology professor at Colorado College, a private liberal arts college in Colorado Springs.
Microbes—which include bacteria, viruses, fungi, and protozoa—"evolve faster than we do because they can reproduce in such a short time," she said.
Case in point: the flu.
"The interesting thing is that every global (flu) pandemic since 1918 has had at least some genes from the flu pandemic of 1918-1919, all these years later," she said.
The Helix study's findings are highly unlikely to have been caused by contamination or technical artifacts, the authors asserted, citing resequencing and the processing of co-infected samples on different days, among other evidence.
A study published on March 8 in The Journal of Clinical Investigation found evidence of five fully vaccinated Spanish COVID patients with breakthrough infections of the Alpha variant, which swept the United Kingdom in late 2020, with features of the Delta Plus, Iota, and Omicron variants.
"Deltacron" is a media portmanteau. Scientists and have not yet officially named the variant. Neither the World Health Organization nor the CDC has named it a variant of concern.
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